2007年10月，于丹担任北京师范大学艺术与传媒学院副院长。2012年7月，担任首都文化创新与文化传播工程研究院院长和北京师范大学文化创新与传播研究院院长。2013年5月，担任北京师范大学艺术与传媒学院分党委书记。2018年，担任北京师范大学粤港澳大湾区文化创新与传播研究中心首席专家；同年，卸任北京师范大学艺术与传媒学院党委书记。

于丹的姥姥是旗人，大家闺秀，曾就读于张之洞建立的女子师范学校，学养很深。于丹3岁时，姥姥便用卡片教她识字、背诗词。

于丹的父亲是于廉，毕业于无锡国专，与范敬宜是同学。其父亲长期从事中国古典文学研究，被誉为“国学大家”。

受父亲的影响，于丹对唐诗宋词产生了浓厚的兴趣，并将诗人李商隐当作自己的偶像。

于丹自2000年以来先后为中央电视台12个电视频道中的近50个电视栏目进行策划，并担任中央电视台新闻频道、音乐频道筹建、现任中央电视台新闻频道、西部频道、科教频道总顾问和北京电视台首席策划顾问。她曾应邀为中央电视台、北京电视台

2002年至2004年期间，于丹以首席研究员的身份主持《电视频道包装研究》《电视谈话节目研究》等中央电视台研究处科研项目，并主持编著《2004中央电视台制片人手册》。她还作为骨干成员参与国家级科研课题《中国影视民族化理论研究》和国家级青年科研课题《电视栏目化研究》。并在《中国社会科学》《文艺研究》《现代传播》《中国社会科学》《南方电视学刊》等重要学术刊物发表美关于电视理论、新闻与传播、传媒产业等领域论文10余万字，引起影视与传媒学界的重视。除此之外，她还担任《中国广播电视学刊》编委工作。

于丹先后为辽宁、河北、浙江、安徽、贵州、湖南、湖北、江西、河南、山东、北京等20余家省级电视台和大连、青岛、沈阳、长沙、武汉等20余家市级电视台做业务培训，授课获得好评。她还在转型时期中国电视运营理念、省级上星台生存策略、中国电视新闻发展趋势、城市形象整体策划、电视频道整体包装等方面有较深入的理论研究。

自2001年起，于丹便开始研究城市品牌资源整合及城市形象战略，先后为重庆、珠海、桂林、沈阳、丽江、秦皇岛市北戴河区提供完备的城市整体品牌规划及城市形象战略方案，并在重庆、丽江、沈阳市委多次授课，专题讲授文化体制改革研究。

于丹在中央电视台《百家讲坛》《文化视点》等栏目传播传统文化，在海内外文化界、教育界产生影响。先后在中国、新加坡、日本、马来西亚、法国、巴西等地进行百余场传统文化讲座，掀起海内外民众学习经典的热潮。于丹编著的《于丹〈论语〉心得》等著作累计销量达600余万册，并翻译成日文、英文、韩文等30种文字在世界发行。

于丹在北京师范大学先后执教本科生课程《影视学概论》《中国古典文学》和研究生课程《电视理论思潮》等，并在北京大学、北京广播学院电视学研究生班固定授课。

于丹先后为中央电视台经济频道、社教频道、法制频道等拍摄多条公益宣传片，多次出席国际公益慈善论坛，并获得“国际慈善名人大奖”。并前往山东临沂、四川宜宾参与乡村公益活动，看望慰问留守儿童。

于丹参加四川公益“名人大讲堂”，为观众讲解李白的作品和风骨，全网共计110万人在线实时观看。

社会需要更多于丹教授这样的学者，让经典走出象牙塔，以大众最能接受的方式传播出去，惠泽社会和人民。（汤一介 评）

儒道经典关注生命价值，重视“心”就是重视生命的体现，“心”就是精神生命、思想生命，于丹教授的讲读重视对“心”的阐发，传播了中华传统文化的思想精髓，她是在做一项很有意义的工作。（陈鼓应 评）

于丹的古典今读，可以说是完成了众多国学家的一个心愿，即让经典走近时代，贴切人心，发挥其应有的道德教化、启发民智的作用——她不但做到了，而且做得很成功。（李泽厚 评）

神闲气定，娓娓道来；古今中外，信手拈来。诚可谓妙趣天成，观之可以忘忧也。（易中天 评）

于丹讲的《论语》，用的一些基本概念，都说明她不懂《论语》，她连传统的分章也没有搞清，把两个不同时期的章节混作一章，没有常识。（历史学家朱维铮 评）

于丹之所以能暴得大名，一方面来自于她以媒体中人的敏感捕捉到了当时受众的普遍心理需要，并以煽情蛊惑的演讲加以迎合(“心灵鸡汤”)，另一方面是，她由中国受众最广的电视媒体捧出。我以为，以“国学”行市，于丹无论从知识层面，还是从精神层面，恐都有难以弥补的局限。她声称自己四岁读《论语》，但对《论语》的解说错误百出，而讲《庄子》更是臆断妄议，基本文理不通。实在讲，于丹讲国学，犹如没有根底的票友在“曲苑杂坛”里充大师。（清华教授肖鹰 评）

于丹是人造的所谓大师，被人轰下台是早晚的事。课讲得好不等于学问高深，于丹充其量就是个老师，站在讲台讲课就行了，何苦到处扮大师状。（作家红荷 评 ）

关键不在于丹当时说了什么或曾经说过什么，而是她一向的言行，过度透支了公众对她的兴趣——时时说、到处说、什么都说。她的遭遇也提醒所有正在兴头上的公众人物：即使你回回口吐莲花，大伙也有听烦的时候。何况说得太多，‘心灵鸡汤’不断加水，既没有营养，也容易反胃。（北京青年报评论员张天蔚 评）

有网友指出，于丹在《〈庄子〉心得》第6讲《总有路可走》中，用“美轮美奂”词语来形容舞蹈《千手观音》是错误的表达方式，这个词一般用来形容建筑之美。随后，许多网友跟帖指出于丹念错字，如把“狡黠”的“黠”读成了“jie”、把“扪心自问”中的“扪”字声调读成了第四声、把“秽”读成“sui”等问题。针对此问题于丹表示，查实后如果确实错了会接受批评。

2007年3月2日，中山大学博士徐晋如在天涯网上发布“我们为什么要将反对于丹之流进行到底”的帖子，文中称于丹“极度无知，传播错误的甚至有害的思想”，还呼吁不要再闹出“把厕所当客厅的笑话”，并要求《百家讲坛》节目应立刻让于丹下课，并向观众道歉。除此之外，帖子上还有中山大学博士生刘根勤、清华大学博士生王晓峰、暨南大学博士生周韬、中山大学副教授朱崇科以及北京师范大学学生杨旸等人的签名，称“要将于丹抵制到底”。随后不久，以徐晋如为代表的“十博士”推出专门针对《论语心得》和《庄子心得》中重大错误的新书《解“毒”于丹—告诉你未被糟蹋的孔子与庄子》。

2007年3月3日，于丹在北京中关村图书大厦举行《于丹〈庄子〉心得》签售会。在会上，一名身穿写着“孔子很生气，庄子很着急”白Ｔ恤的男子突然出现，面对记者的提问，他只回答两个字“批判”。

2007年5月，于丹应邀首次到访日本，日本民众喊出“欢迎女孔子的到来”等语句。针对此现象，《日本新华侨报》发文提出质疑，认为或许确实有日本人称于丹为“女孔子”，但这种只是社交礼节，日本是否能接受于丹的解读还是未知，所以没有必要大吹特吹。

2009年5月5日，一位英国在读的女博士在网络上发布一篇名为《于丹伦敦街头撒泼记》的帖子，帖子用中英文详细记录了于丹“不断换房耍大牌”、“呵斥助理”、“辱骂翻译”等行为，引起网友讨论。针对此事，于丹表示自己确实换了房间，但是是因为房间在电梯隔壁，而“呵斥助理”一事是子虚乌有。

2010年，孔子七十五代孙孔健出版《于丹的天空》一书，在书中夸赞于丹。随后于丹表示该书刊登了大量未经她授权的演讲内容。于是于丹委托律师给全国各地的新华书店发出律师函，称孔健的《论语力》《于丹的天空》《左手孔子右手庄子》《新论语》四部书籍侵犯了于丹的民事权利，要求新华书店将书籍下架。孔健针对此事召开新闻发布会表示此举没有法律依据。

2012年，中国作家协会公布拟发展会员的公示名单，于丹在名单之中，有部分网友表示于丹没有资格加入中国作家协会。针对此事中国作家协会新闻发言人陈崎嵘表示，于丹是中国作家协会会员提名推荐加入的，其作品不容易分类，所以放在其他类目中。深圳市作协副主席、深圳大学文学院副院长南翔表示，中国作家协会大多数为业余作家，传统意义上的专业作家已经越来越少了，如果于丹以文学教授的身份加入中国作家协会，估计也可行。

2012年11月17日，在北京大学百年讲堂举行的一场昆曲名家的演出上，于丹作为主办方邀请的嘉宾在谢幕后上台致辞，结果却被观众轰下台。于丹表示，是主办方一再邀请才上台，只想向老艺术家表示致敬。

2015年9月4日，于丹发布微博，在微博中引用清朝光绪皇帝在京师大学堂的“开学讲话”，以此勉励新生。随后有网友指出，这篇“光绪讲话”是假的，来源于一部网络小说。随后不久，于丹删除此条微博。